本清单依据国家税务总局深圳市税务局官方发布的政策指引整理，企业需在享受优惠年度企业所得税汇算清缴期结束后，将下列资料归集齐全并留存10年，以备税务机关核查。
（一）通用备查资料（自主/委托境内/合作/集中研发项目通用）
1.研发项目立项核心文件：自主、委托、合作研究开发项目计划书，以及企业股东会、董事会等有权部门关于该研发项目立项的正式决议文件；计划书需明确研发目标、核心技术创新点、技术路线、研发周期、项目组人员、研发预算等关键内容，佐证研发活动的实质性创新。
2.研发机构与人员资料：自主、委托、合作研发专门机构或项目组的编制情况说明、研发人员名单（含外聘研发人员）；名单需明确人员岗位、研发职责、参与项目情况，配套留存研发人员工时统计台账、社保缴纳记录、薪酬发放凭证等。
3.研发合同登记资料：经深圳市/各区科技行政主管部门（技术合同登记机构）登记的委托研发、合作研发项目正式合同；委托境内研发由受托方办理登记，委托境外研发由委托方自行办理登记。
4.费用分摊与归集依据：从事研发活动的人员（含外聘人员）、用于研发活动的仪器/设备/无形资产的费用分配说明，包括共用资产/人员的工作使用情况记录、工时统计、费用分摊计算方法及证据材料，清晰划分研发活动与生产经营活动的费用边界。
5.集中研发专项资料：集中研发项目的研发费决算表、费用分摊明细情况表、实际分享收益比例等相关资料。
6.研发费用核算资料：按规定编制的**“研发支出”辅助账及汇总表**；企业可自主选择2021版简化辅助账样式、2015版辅助账样式，或自行设计辅助账（需包含2021版核心数据项，逻辑关系一致，可准确归集可加计扣除的研发费用）。
7.研发项目鉴定意见：企业已取得的地市级（含）以上科技行政主管部门出具的研发项目鉴定意见，需完整留存备查。
8.研发成果佐证资料：研发项目对应的成果证明材料，包括专利申请/授权证书、软件著作权登记证书、检验检测报告、新产品/新工艺查新报告、项目结题验收报告等，用于佐证研发活动的实际产出与创新价值。
9.直接材料全流程凭证：研发用材料的采购合同、发票、入库单、领用单、损耗说明、废料/残次品/试制品处置记录及收入凭证；深圳税务将直接材料费用真实性列为核心核查重点，需留存完整的材料流向证据链。
（二）委托境外研发项目额外备查资料
企业委托境外开展研发活动享受加计扣除优惠的，除上述通用资料外，还需额外留存以下资料：
1.委托境外研发项目计划书和企业有权部门立项的决议文件；
2.委托境外研发专门机构或项目组的编制情况、研发人员名单；
3.经科技行政主管部门登记的委托境外研发合同；
4.委托境外研发的银行支付凭证、受托方开具的合法收款凭据；
5.当年委托研发项目的进展情况说明；
6.境外受托方不属于境外个人的主体资格证明材料；
7.委托境外研发费用不超过境内符合条件研发费用总额2/3的测算说明及佐证材料。
（三）深圳市研发费用加计扣除违规被查典型企业案例
案例一：深圳金斯达应用材料有限公司虚列研发材料支出偷税案（官方通报重大案件）
•查处单位：国家税务总局深圳市税务局稽查局
•通报时间：2025年5月
•核心违法事实：
a.虚构研发项目，编造需大量使用黄金材料的研发项目，在30余个申报的研发项目中，17个项目无黄金使用的合理研发流程，却在“研发费用—直接材料”科目虚列高达8000余万元的黄金材料消耗支出；
b.以“黄金提纯高额损耗”为由搪塞核查，经税务机关协查第三方权威黄金提纯机构，证实黄金提纯工艺基本无实质性损耗，企业无法提供黄金采购、领用、损耗、最终流向的完整证据链；
c.通过关联方交易虚增黄金采购规模与采购价值，将非研发用途的黄金支出违规纳入研发费用，进行虚假纳税申报，违规享受100%研发费用加计扣除优惠；
d.同时存在其他少缴税款的违法行为。
•处理处罚结果：
a.依法追缴少缴企业所得税1621.16万元；
b.按日加收万分之五的税收滞纳金；
c.对偷税行为依法处以罚款；
d.上述追缴税款、滞纳金、罚款合计3618.15万元；
e.企业纳税信用等级直接降为D级，高新技术企业资质面临专项复核，后续年度税收优惠享受资格受到严格限制。
•官方通报链接：
https://shenzhen.chinatax.gov.cn/sshzqswj/gzdt/202505/c28d950566c948bf9793d05fbe1aaa19.shtml
案例二：深圳龙岗区H科技公司违规归集委托研发费用案
•查处单位：国家税务总局深圳市龙岗区税务局
•披露时间：2025年10月
•核心违法事实：
a.该企业为软件企业，委托关联企业开展软件研发，申报委托研发费用1030万元，经税务核查，符合规定的合理委托研发费用仅为338万元，违规多计研发费用692万元；
b.关联方委托研发定价明显高于市场公允价格，未按独立交易原则合理归集研发费用，违规享受研发费用加计扣除优惠；
c.研发费用违规调减后，企业当年研发费用占销售收入比例低于6%，不符合软件企业所得税“两免三减半”优惠政策的核心享受条件。
•处理结果：
a.企业按税务机关要求调减2022年度违规归集的研发费用，重新完成合规归集；
b.依法补缴2022年度少缴的企业所得税，并按规定加收滞纳金；
c.取消企业当年软件企业“两免三减半”优惠政策的享受资格。
•官方披露链接：
http://www.ctaxnews.com.cn/sswfaj/2025-10/09/content_1114291.html
案例三：深圳宝安区某电子科技企业虚列研发人员薪酬违规案
•查处单位：国家税务总局深圳市宝安区税务局
•查处时间：2024年12月
•核心违法事实：
a.企业将行政、财务、生产车间等非研发部门人员的薪酬全额计入研发费用，违规归集研发人员人工费用2100余万元；
b.对兼职参与研发的人员，未按实际工时占比合理分配薪酬费用，将人员全部薪酬违规纳入研发费用加计扣除范围；
c.无法提供研发人员的工时台账、岗位职责说明、研发项目参与记录等佐证材料，研发人员人工费用归集无合法合理依据。
•处理处罚结果：
a.依法调减违规归集的研发费用，追缴少缴企业所得税525万元；
b.按规定加收税收滞纳金，并处以少缴税款0.6倍的罚款315万元；
c.对企业开展专项纳税辅导，要求企业建立研发人员全流程管理制度，规范研发费用归集流程。
四、合规风险提示
1.研发活动的实质性创新是享受优惠的核心前提，严禁虚构研发项目、凑数立项，无创新属性的常规性工作不得纳入研发范畴。
2.研发费用归集必须严格遵循真实性、相关性、合理性三大原则，清晰划分研发与生产经营的费用边界，不得将与研发活动无关的支出违规计入。
3.务必按官方要求完整留存备查资料，建立研发项目从立项、实施、成果转化到费用归集的全流程档案，确保每一笔研发费用都有完整的证据链支撑。
4.委托研发、合作研发需按规定完成技术合同登记，重点关注关联交易定价的公允性，避免因交易不合规导致优惠资格被取消。
5.2026年税务监管持续升级，建议企业在汇算清缴前开展研发费用合规自查，提前排查整改风险点，避免违规行为引发的经济损失与信用惩戒。
如果你的企业遇到上述痛点问题，也不清楚该如何准备备查材料，欢迎来找我聊聊。
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