在这篇综述中，团队首先从SR蛋白的结构本质出发，厘清了植物SR蛋白家族的分类体系与进化特征。研究明确，植物SR蛋白的核心骨架由N端的RNA识别基序（RRM）与C端的精氨酸-丝氨酸富集（RS）结构域构成——前者负责特异性识别并结合RNA靶标，决定了剪接调控的序列特异性；后者则主导剪接体的组装与蛋白间的互作，是SR蛋白发挥剪接激活功能的核心元件。基于结构特征，植物SR蛋白可划分为6个亚家族，其中SR、SC、RSZ亚家族在动物中存在同源基因，而RS、SCL、RS2Z三个亚家族为植物所特有，部分植物特有亚家族还携带锌指结构等附属元件，进一步赋予了其独特的RNA结合特性与调控功能（图1）。
图1 拟南芥蛋白基因家族示意图，展示了SR蛋白成员的结构域组成
在此基础上，综述打破了过往研究仅聚焦SR蛋白剪接功能的局限，构建了其贯穿mRNA全生命周期的整合调控网络。团队系统阐释了SR蛋白如何实现转录与剪接的协同调控——它不仅能通过精准识别剪接调控元件，全程参与剪接体的组装与成熟，决定剪接位点的选择与剪接效率，还能协同相关RNA元件解除转录暂停，将转录延伸与剪接过程深度偶联。同时，SR蛋白还深度参与翻译起始的调控与RNA质量控制，既可以通过互作翻译因子激活蛋白翻译，也能通过稳定外显子连接复合物激活无义介导的mRNA降解通路，清除异常转录本，维持植物基因表达的稳态（图2）。
图2 SR蛋白调控的选择性剪接机制
值得关注的是，综述还重点解析了SR蛋白功能调控的上游机制，系统梳理了磷酸化修饰与液-液相分离（LLPS）两大核心调控方式。其中，由特定激酶与磷酸酶构成的磷酸化-去磷酸化平衡网络，直接决定了SR蛋白的活性与亚细胞定位；而液-液相分离则是近年来发现的植物SR蛋白响应胁迫的新型调控机制，SR蛋白可通过相分离形成核内凝聚体，在逆境条件下快速重编程宿主的剪接程序，实现对环境胁迫的快速响应。
围绕SR蛋白的生物学功能，综述全面勾勒了其在植物全生命周期与逆境响应中的调控图景（图3）。从胚胎发育、种子萌发到营养生长、开花生殖，SR蛋白在植物生长发育的各个阶段都发挥着不可替代的作用；而在盐、干旱、低温、重金属胁迫与病原菌侵染等逆境条件下，不同的SR蛋白亚家族会通过特异性的剪接调控，重编程植物的逆境响应网络，帮助植物适配复杂的外界环境。综述中梳理的大量实证研究也证实，SR蛋白的功能缺失或异常表达，会直接导致植物出现严重的发育缺陷与抗逆能力下降，进一步印证了其作为核心调控节点的重要性。
图3 SR蛋白调控植物生长、发育与胁迫应答的功能模型
同时，针对领域内的研究技术需求，综述还系统梳理了SR蛋白相关可变剪接分析的生物信息学工具与测序技术方案，结合不同研究场景提出了适配的工具组合策略，为后续植物SR蛋白与可变剪接相关研究提供了可直接参考的标准化技术路径。
