4月29日(周三),第57期相聚植化云端交流活动,我们非常荣幸地邀请到中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所研究员、国家海外高层次青年人才项目获得者、德国洪堡学者——石一鸣老师,为大家带来《微观生态互作启发的先导化合物发现:从化学生态学到合成生物学》的线上报告。
石一鸣老师很少在外做公开报告,本次能够邀请到他,特别要感谢胡正喜老师的大力协助和热心邀约。正是在胡老师的牵线下,我们才得以与石老师取得联系,并最终促成这次云端交流。石老师师从孙院士,继承了课题组在天然产物与合成生物学领域的深厚积淀,同时开辟出自己独特的研究方向——将微观生态互作中的化学生态学线索,与现代合成生物学手段相结合,为新型先导化合物的发现提供了全新的思路。
石老师长期围绕微生物天然产物、合成生物学与化学生态学开展交叉研究,聚焦活性天然产物挖掘、生物合成机制解析、生态功能研究及工程化改造,致力于发现具有应用潜力的新型活性分子并推动其优化与转化。相关成果发表于 Nature Chemistry、Nature Chemical Biology、Nature Microbiology 等期刊,发表论文60余篇,获授权专利两项。
在本次报告中,石老师将围绕“微观生态互作启发的先导化合物发现”这一主题展开。他指出,天然产物并非微生物代谢的偶然副产物,而是在竞争、共生、捕食与防御等生态互作中被持续塑造的功能分子。报告将从化学生态学出发,讨论如何从微观生态中的“生存之战”识别具有生物学功能的分子线索,并进一步结合基因组挖掘、天然产物化学和合成生物学,将生态启发转化为先导化合物发现的新路径。
石老师是孙院士的得意门生,我们特别邀请了他的两位同门师兄弟——汪伟光和颜秉超,从朝夕相处的视角写下他们心中真实的石老师,特别是汪老师,写的十分有意境,非常有八零后风格。感谢两位老师的支持,相信这些文字能让大家在聆听报告之前,先走近一位潜心科研、待人真诚的学者。
汪伟光(云南民族大学):昆明四季绿茵茵的,太阳照在昆明植物所瓦屋上,总像蒙着薄薄的水雾。2010年我在那里认得了石一鸣。他瘦瘦的,见人低着头,眼睛细细的,笑起来眯成一条缝,倒亮得很。我头回见就想,这人的眼睛同我倒有几分像。熟了便喊他“帅弟”,他听了脸红到耳根,日子久了,安安静静笑一笑。
那几年在一处做实验。实验室窗子朝东,早半天太阳斜斜照进来,瓶瓶罐罐亮晃晃的。他总一早就来,换上白褂子,伏在桌前弄五味子的降三萜——分离、鉴定,末了用量子化学算构型。过柱子时,人站那儿盯着玻璃管里液面,一看就是个把钟头。图谱摊在桌上,拿支铅笔点点画画,眉头微蹙。我走过去敲敲桌沿,他才恍恍抬头。两人摘了手套,站廊檐底下晒太阳,说试验上的事。他说话慢慢的,一句是一句,说到心爱处,那双细眼睛便放出光来。四年工夫,不知不觉过去了。
2014年他博士读完,走那天我去送。香樟树绿得发黑,蝉叫得人心慌。他站在车旁,安安静静笑着,说:“师兄,我走了。”车子拐弯就不见了。回到实验室,见他桌上收拾得干干净净,只剩盏台灯、个空笔筒,心里忽然空落落的。
后来他得洪堡奖学金去法兰克福大学,我拿JSPS去了东京大学。隔着千山万水,倒常通电话,说实验室的事,说德国面包硬,说又做出什么新东西。放下电话总要想想,仿佛他还坐在隔壁那张桌前。
2019年他文章登在《自然·化学生物学》上。又过了些时,孙老师八十寿辰,他妻子小史抱着女儿来,指着我说:“这个就是你爸爸常说的那个汪师兄。”孩子乌溜溜的眼睛看着我,大家都笑了。他站在旁边,眼睛眯成一条缝。
2022年他又发了《自然·化学》,2023年得海外优青,2024年聘到先进院,自己独立做实验室了。
17年隔着数不清的山和水,却像从没分开过。他那个人,话不多,心是热的;人静静的,那点聪明和痴迷,像暗夜里的萤火,自顾自亮着。人活一辈子,能遇见这样一个师弟,实在是不可求的事。
颜秉超(中国科学院昆明植物研究所):在每一位科研工作者的研究生阶段,如果身边能够遇到优秀而值得学习的师兄师姐,无疑是一件非常幸运的事情。我自己就深感幸运,在刚进入研究生阶段、还是“科研小白”时,便和石一鸣师兄相识。我进组读研时,他已由硕士转为博士,在读博士二年级。我们曾有一年多时间在同一间实验室学习。正是在那段朝夕相处的科研时光中,师兄严谨投入的科研状态给我留下了深刻印象,也对我产生了很大的激励和帮助。博士期间,他主要开展两种五味子的三萜化学研究,分离鉴定了多种新骨架化合物,在复杂五味子降三萜结构解析方面展现出扎实过硬的专业能力,在经典植物化学研究中有着过硬的“看家本领”。在我的印象中,师兄是那种既聪明又勤奋的人。当时半制备液相需要大家轮流一天使用。为了尽可能提高仪器使用时间,他常常通宵达旦,一边接峰,一边看文献、解谱;即使到了深夜,依然保持高度专注。在繁忙科研之余,他每周还会到研究所球场踢足球,这也让我非常佩服他的体能和自律。可以看得出,他无论对待科研还是生活,都是非常投入和专注的人。
师兄的学习能力很强。在量化计算还不像现在这样流程化、标准化的时候,他就主动钻研相关方法,并将其应用于复杂降三萜结构立体化学的确证中,解决了研究中的关键问题。毕业后不久,师兄在竞争激烈的洪堡奖学金申请中脱颖而出,以“洪堡学者”身份赴德国开展博士后研究。博士后期间,他进一步拓展到微生物化学生态学交叉研究领域,进入了当前天然产物研究中极具前沿性的方向之一。博士后出站后,他在德国马普陆地微生物所获得教职;两年后,又决定回国发展。多年来,师兄始终保持着对天然产物研究的浓厚兴趣,也形成了自己独立而深入的思考。虽然我现在的研究方向与师兄也不一样,但每次与他聊起科研,总能感受到他的热情与洞见,也常常收获启发。相信他本次报告会为听众带来新的思考和启迪。