医院是国家级研究型医院建设单位、广东省高水平医院重点建设单位，拥有5个国家级平台、1个国家级建设项目、2个省级研究中心、5个省级重点专科、5个市级重点专科、7个市级工程载体和20 项医疗卫生三名工程团队。2023年，国家三级公立医院绩效考核医院获评A级；在医院学科STEM排名中，6个学科进入全国百强。在中国医院创新转化排行榜中，医院创新转化全国第67，专利转化量全国第41。临床医学学科跻身ESI学科排名前1%。
近五年，医院承担了各级各类纵向科研项目180 余项，包括国家科技部科技创新2030重大项目子课题、国自然项目、省自然项目、市科创委重点项目等，纵向科研经费1.2亿余元；发表SCI论文900余篇，影响因子（IF>10）论文近 100 篇；牵头、参与制定国际国内指南、规范、标准 70余部；获各级各类成果奖项 14 项；授权专利 536 项，其中发明专利 81 项，实用新型 450项，外观设计 5 项。未来，医院将以建设国家儿童区域医疗中心为标准，努力建成「高水平、研究型儿童医院」，实现高质量发展。
