深圳大学总医院癫痫中心于2018年10月获批成立，中心于2020年获得深圳市政府“三名工程”支持，引进首都医科大学宣武医院王玉平教授癫痫多学科诊疗团队，规范化癫痫诊疗流程及难治性癫痫术前评估流程，将门诊就诊、脑电图监测、脑功能评估、线上查房、多学科会诊、远程线上疑难病例会诊讨论以及手术、术后康复紧密结合，发展以“患者为中心”的多地、多学科诊疗模式，为更多的癫痫患者提供一站式诊疗服务。
2024年11月，深圳大学总医院癫痫中心正式获批成为国家级综合癫痫中心。
孟祥红主任带领的神经电生理团队和神经心理团队进行专业的术前评估、术前术后药物调整和功能区评估与定位，中心两位成员以高分取得国家脑电图高级证书。孟祥红主任参与国内癫痫外科术前评估、SEEG技术等多个相关中国专家共识的撰写及修订，在2022年承办亚洲及大西洋洲癫痫综合征学习班上，国际抗癫痫联盟亚大地区主席John Dunne教授在总结发言时及邮件上反复称赞深圳大学总医院癫痫团队诊疗水平卓越。此外，孟祥红主任带领团队开展适合于国人的系统性癫痫神经心理评估技术，是国内开创性工作，弥补国内在该领域的空白，2021年癫痫中心举办第一期癫痫神经心理评估学习班，将先进的神经心理评估推广及普及，我国癫痫领域泰斗吴逊教授为学习班致辞中提到孟祥红主任对推动神经心理评估“中国化”做出了极大的贡献。
石鑫主任带领的外科医生团队进行各种专业的手术治疗，已成熟开展各种复杂性高难度癫痫灶切除手术，如术中唤醒下功能区致痫灶切除术、标准前颞叶切除、选择性海马杏仁核切除、裁剪式致痫灶切除、小骨窗胼胝体全段切开、多脑叶切除、大脑半球离断等高难度手术广泛开展，手术技术日臻娴熟，手术患者术后并发症少、癫痫不发作率高（超80%），受到广大癫痫患者的认可和业内同行的赞许。此外立体定向脑电图(SEEG)、迷走神经电刺激(VNS)、脑深部电刺激（DBS）等已是我科癫痫常规手术。
