东莞市麻涌镇水务工程运营中心因非法占地被重罚。该财政补助的事业单位在2023年未经批准,擅自在麻涌镇漳澎村建设硬底化道路。依据《土地管理法》等相关法规,东莞市自然资源局对其作出处罚:要求退还非法占用土地,没收相关建筑,并按每平方米200元处以罚款,罚款716.718万元。