广东省低视力康复技术指导中心深圳基地及卫生部“视觉第一中国行动”深圳培训基地、广东省临床规范化培训眼科学基地、眼科专培基地、深圳大学临床医学和深圳职业技术大学眼科实习基地。全国外伤性视神经病变临床诊疗与研究协作组深圳分中心共建单位、深圳市视光学会神经眼科专委会主委单位、深圳市糖尿病相关眼病防治中心。2022年中国医院科技量值（STEM）专科排名及近五年综合排名均进入全国百强。
于2000年深圳市综合医院最早率先开展了激光治疗近视，超声乳化治疗白内障及人工晶体植入术，玻璃体切割治疗眼底病等。目前已经搭建国际最新个性化引导全光塑激光smile4.0、icl全手术平台服务体系建设。除此之外，目前拥有并开展复杂性白内障、眼外伤手术和近视防控（OK镜等）、斜弱视、干眼、神经免疫性眼科疾病等亚专科。
设有眼科病房，眼科门诊、屈光手术中心。现有医护人员35人，其中主任医师6人，副主任医师5人，博士6人，硕士8人。硕士研究生导师3人，已培养硕士研究生20余名，常年培养进修医生和规培生。眼科有三间独立手术室，眼科病区开设病房40张。科室技术力量雄厚，其临床、教学和科研在深圳市有较强的影响力和良好的口碑。
